Date of Award

11-2019

Document Type

Thesis

Degree Name

Master of Science (MS)

Department

Biology

First Advisor

Sofyan Alyan

Second Advisor

Taoufik Ksiksi

Third Advisor

Mohammad Shahid Nazir

Abstract

Understanding the genetic structure of threatened and endangered species is important in management and conservation efforts. Measuring the pattern and scale of genetic variation within and among populations is important for understanding population dynamics. It helps us improve our understanding of the ecological and genetic relation between the populations. The current research looks at the population structure of the endemic seabird of the United Arab Emirates (UAE), the Socotra cormorant (Phalacrocorax nigrogularis). The lack of genetic information, increased threats, and small breeding habitats of the Socotra cormorants, makes it important to investigate the genetic population structure in the UAE. The aim of this research is to assess the level of genetic variation and structure within Eastern and Western Socotra Cormorant populations, using descriptive molecular genetic analysis. Using known mtDNA and nDNA primers of avian and cormorant species, we investigated the genetic differentiation and structure of the Socotra cormorants and assessed their genetic diversity. The results revealed that the Western and Eastern populations have low genetic differentiation and high gene flow. Also, they have low genetic diversity across all populations, which might indicate that the UAE population is recovering from a long-term bottleneck or an event of selective sweep. Now we have a closer insight into their genetic diversity, a further study of whole genome sequence (WGS) is required to get a better understanding of the population’s genetic history and dynamics. This will enable us to additionally understand the Socotra cormorant global population and their connectivity.

Comments

إن فهم التركيب الوراثي لأنواع الكائنا ت المهددة والمعرضة للانقراض مهم لفهم ادارتها والمحافظة عليها. قياس نمط وحجم التباين الوراثي داخل وبين الأعداد يعد أمر هام ويساعدنا على تحسين معرفتنا للعلاقة الإيكولوجية والجينية بين المجموعات. في بحثنا اننا ننظر في التركيب الجيني للطيور البحرية المستوطنة في دولة الإمارات العربية المتحدة وهو الغاق السقطري .(Phalacrocorax nigrogularis) إن قلة المعلومات الوراثية والتهديدات المتزايدة وتقلص مدى السكن الطبيعي للغاق السقطري يحثنا على التحقيق في تركيبتها الوراثية. الهدف من هذا البحث هو تقييم مست وى التباين الوراثي والبنية الجينية داخل مجموعات سر ب الغاق في شرق وغرب الدولة ، باستخدام الوصف والتحليل الوراثي الجزيئي. استخدمنا علامات الجينية على mtDNA و nDNA الوراثي بين مجموعات السرب وقيمنا التنوع البيولوجي. أظهرت النتائج أن الاعداد الغربية والشرقية لديهم تمايز جيني منخفض جدا وتدفق جيني مرتفع. وأن التنوع الجيني منخفض في كلى الأسرا ب مما قد يشير إلى أن الأعداد تتعافى من حالة bottleneck منذ المدى الطويل أو من حدث اكتساح انتقائي. الآن لدينا نظرة فاحصة على تن وعها الجيني وهناك حاجة إلى مزيد من الدراسات لتسلسل الجينوم الكامل (WGS) للحصول على فهم اوضح للتاريخ الجيني وديناميكية الأعداد. بالإضافة انه سوف يمكننا من فهم تفاعل واتصال أعداد الغاق السقطري ببعضها البع ض حول العالم .

Download

Share

COinS