Date of Award

6-2019

Document Type

Thesis

Degree Name

Master of Science (MS)

Department

Biology

First Advisor

Dr. Ranjit Vijayan

Second Advisor

Dr Mohammed Akli Ayoub

Third Advisor

Syed Salman Ashraf

Abstract

Rheumatoid arthritis (RA) is an autoimmune disease characterized by chronic inflammation that affects the joints. It occurs when the immune system attacks the body's own tissues and organs. The precise cause of RA is not fully understood but evidence suggests that genes, hormones and environmental factors could be involved. It has been established that human leukocyte antigen (HLA) loci is a strong risk factor of RA. Specifically, the shared epitope (SE) region of HLA-DRB1 and variations at position 11 and 13 of HLA-DRB1 and position 77 of HLA-A have shown strong association with RA. The hypothesis of this study was that these variations could be associated with RA patients in the UAE. To study this, regions of the HLA-DRB1 and HLA-A genes from RA and control samples from Fujairah Hospital were sequenced and analyzed. Results indicated that there was minimal incidence of high risk HLADRB1 SE or variations at position 11 and 13 of HLA-DRB1 in these samples. An asparagine at position 77 (Asn77) appeared to be a much strong biomarker for RA in this population (Odds ratio = 20.52, p-value = 0.0001985). Additionally, missense mutations Arg56 and Glu76 were also observed with significantly higher incidence in RA samples. The relevance of these variations warrant further investigation. In summary, HLA-A appears to be a stronger indicator of RA than HLA-DRB1 in the samples analyzed.

Comments

التهاب المفاصل الروماتويدي(RA ) هو مرض مناعي ذاتي يتميز بالتهاب مزمن )RA( التهاب المفاصل الروماتويدي يصيب المفاصل. يحدث عندما يهاجم الجهاز المناعي أنسجة الجسم وأعضائه. السبب الأساسي للإصابة بإلتهاب المفاصل الروماتيدي ليس مفهوما بالكامل، لكن الأدلة تشير إلى أن الجينات والهرمونات والعوامل البيئية يمكن أن تكون سببا في ذلك. لقد ثب ت أيضا أن مستضد كريات الدم البيضاء البشرية (HLA) ، هو عامل خطر وقوي لالتها ب المفاصل الروماتويدي. على وجه التحدي د، أظهرت منطقة الحلقة المشتركة (SE) من HLA-DRB1 والتغيرات في الموضع 11 و 13 من HLA-DRB1 والموقع 77 من HLA-A ارتباطًا قويًا بالتهاب المفاصل الروماتيدي . وقد وضعنا فرضية أن هذه الاختلافات يمكن أن ترتبط بمرضى التهاب المفاصل الروماتويدي في دولة الإمارات العربية المتحدة. وعليه تم دراسة وتقييم تسلسل الحمض النووي HLA- DRB1 وHLA-A من مرضى إلتهاب المفاصل الروماتيدي من مستشفى الفجيرة ومقارنتها بعينات لأشخاص غير مصابيين بالمرض. أشارت النتائج إلى أن هناك نسبة ضئيلة من – DRB1 SE HLA عالية المخاطر وكذلك نسبة خطورة ضئيلة في الاختلافات في الموضع 11 و 13 من DRB1 SE في هذه العينات. ظهر الحمض الأميني )اسبرجين( في الموضع 77 (Asn77) ليكون علامة حيوية قوية للمرض في هذه الفئة من السكان )نسبة الأرجحية = 20.52 ، القيمة (p = 0.0001985 بالإضافة إلى ذلك؛ لوحظت طفرات خطأ في موقعيين آخريي ن Arg56 و Glu76 بنسبة أعلى بكثير في عينات في فئة المصابيين بالمر ض . أهمية هذه الاختلافات يستدعي المزيد من التحقيق. باختصار، يبدو أن HLA-Aهو مؤشر أقوى علىRA من HLA-DRB1

Download

Share

COinS