Date of Award

11-2020

Document Type

Thesis

Degree Name

Master of Science (MS)

Department

Biology

First Advisor

Dr. Yusra Saif Al Dhaheri

Abstract

Breast Cancer (BC) is the most common cancer and the second most cause of death among women. Mutations in BRCA1 and BRCA2 genes confer high susceptibility to both breast and ovarian cancer. However, data on the prevalence of the BRCA1/2 mutations among breast and ovarian cancer patients is limited. The genetic component of breast cancer in the UAE is largely unknown and no study has evaluated the BRCA mutations status in breast and ovarian cancer patients in the UAE population. This retrospective study aimed to establish mutation frequencies of the BRCA genes in breast and ovarian cancer patients from the Northern Emirates and sought to examine the potential association of BRCA carriers and Triple- Negative Breast Cancer (TNBC). The study population included patients who underwent BRCA genetic testing at Sheikh Khalifa Specialty Hospital (SKSH) to determine hereditary breast/ovarian cancer. Mutations in BRCA1 and BRCA2 were analyzed by Sanger sequencing or next-generation sequencing (NGS) along with Multiple Ligation Probe Amplification (MLPA).

Among 262 patients, 224 (85.5%) had no mutation. BRCA mutations were identified in 38 patients (14.5%). BRCA1 and BRCA2 mutations were detected in 6.9% and 7.6% of the patients, respectively. A variant of unknown significance in BRCA1 was found in 0.4% of patients (one patient). TNBC accounted for 22% of all patients with Breast Cancer (BC) who underwent immunohistochemistry (28/127). Importantly, one novel BRCA1 mutation: c. (80+1_81-1) _ (441+1_442-1) dup in exons 3,5,6,7 was observed in one patient with ovarian cancer who showed positive family history and age ≤ 45. Moreover, two novel deletion mutations were identified in the BRCA2 gene. One deletion in exon 5 in ovarian cancer patients who showed positive family history and age ≤ 45. The second was a deletion in exons 10-13 observed in male patients with breast cancer with age ≤ 45. The current study results will help to establish the spectra of BRCA mutations and risks associated with breast and ovarian cancer in UAE patients.

Comments

یعتبر سرطان الثدي أكثر أنواع السرطان شیوعا و ثاني أحد أسباب الوفاة بین النساء. تمنح الطفرات في جینات BRCA1 و BRCA2 قابلیة عالیة للإصابة بسرطان الثدي والمبیض. و مع ذلك، فإن البیانات المتعلقة بنسبة إنتشار طفرات BRCA1/2 في مرضى سرطان الثدي و 2سرطان المبیض محدودة. یعتبر التكوین الجیني لسرطان الثدي الى حد كبیر غیر معروف و لم تقم أي دراسة بتقییم حالة طفرات سرطان الثديفي BRCA لدى مرضى سرطان الثدي و المبیض الثديفي دولة الامارات العربیة المتحدة. تھدف ھذه الدراسة إلى تحدید معدل إنتشار الطفرات الوراثیة في جینات BRCA لدى مرضى سرطان الثدي والمبیض من الامارات الشمالیة، كما سعت إلى فحص العلاقة المحتملة بین حاملین سرطان الثدي BRCA و سرطان الثلاثي السلبي .(TNBC) شملت الدراسة على المرضى الذین خضغوا للاختبار الجیني BRCA في مستشفى الشیخ خلیفة التخصصي (SKSH لتحدید الاصابة بسرطان الثدي / المبیض الوراثي. تم تحلیل الطفرات الوراثیة في جینات BRCA1 و BRCA2 عن طریق إجراء فحص معرفة التسلسل الجیني Sanger أو تقنیة الجیل الجدید لتحدید التسلسل الجیني NGS ضافة إلى فحص التضخیم مسبار الربط المتعدد .(MLPA)

من إجمالي عدد 262 مریض، لم یكن لدى 224 مریض طفرة جینیة في BRCA (85.5% ) ، ، بینما تم تحدید طفرات BRCA لدى 38 مریضاٌ (14.5%) . حیث تم العثور على طفرات BRCA1 و BRCA2 بنسبة 6.9% و 7.6% من المرضى على التوالي. كما تم العثور على طفرات مجھولة الاھمیة في BRCA1 1بنسبة 0.4% من المرضى (مریض واحد). یمثل سرطان الثلاثي السلبي (TNBC) نسبة 22% من إجمالي عدد المرضى (28/127) الذین یعانون من سرطان الثدي و الذین خضغوا لفحوصات الكیمیاء النسیجیة المناعیة .(Immunohistochemistry)

الجدیر بالذكر ھو العثور على طفرة جدیدة في جین BRCA1 (- (80+1_81-1) c. dup ( 1- 442 _ 1+441))؛ وھو حدوث تكرار في اكسون 3,5,6,7 exons في حالة واحدة لمریضة مصابة بسرطان المبیض، لم تتجاوزعمر 45 سنة ولدیھا تاریخ عائلي. علاوة على ذلك، تم اكتشاف طفرتین جدیدتین للحذف في جین BRCA2، احدھما حذف اكسون exon 5 في حالة 2لمریضة لم تتجاوز ال 45 سنة مصابة بسرطان المبیض و لدیھا تاریخ عائلي. و الحالة الثانیة ھو حذف في اكسونات exons 13-10 لوحظت في مریض ذكر مصاب بسرطان الثدي، لم یتجاوز ال45 سنة . ھذه النتائج ستساعد في تأسیس محتوى واضح للطفرات الجینیة BRCA المخاطر الجینیةالمرتبطة بسرطان الثدي والمبیض لدى مرضى شمال دولة الامارات العربیة المتحدة.

Download
COinS