Date of Award

10-2014

Document Type

Thesis

Degree Name

Master of Science in Medical Sciences (MSMS)

Department

Pharmacology and Therapeutics

First Advisor

Bassam R. Ali

Second Advisor

Lihadh Al-Gazali

Third Advisor

George Patrinos

Abstract

Warfarin is the most commonly used oral anticoagulant medication given as a prophylaxis and/or treatment of venous and arterial thromboembolic disorders. Warfarin doses vary up to 10-fold among patients due to pharmacokinetics, pharmacodynamics and pharmacogenomics factors. In addition, Warfarin has a low therapeutic index with the risk of developing serious side effects such as severe bleeding or failure of therapy. Therefore, the main challenge to achieve the therapeutic goal in Warfarin treatment is estimating the appropriate dose for each patient. It is estimated that pharmacogenomic factors contribute to more than 60% of dose variability. The gene encoding for the target enzyme of Warfarin, vitamin K epoxide reductase complex 1 (VKORC1), is a highly polymorphic gene and contributes to about 30% of this variability. The US Food and Drug Administration (FDA) recommends genetic testing to determine the VKORC1 genotype prior to using Warfarin. However, there are no data on VKORC1 alleles and genotypes or their frequencies among Emiratis. Therefore, the current approach is trial and error with warfarin doses which might lead to some serious complications for patients receiving this medication. In this thesis, we used PCR amplification and direct DNA Sanger sequencing to genotype the two most important variants in VKORC1 genes (namely, rs9923231 and rs7294). The sample consisted of 117 healthy Emirati nationals as control and 96 patients on stable Warfarin therapy. The alleles and genotypes frequencies were determined for both groups. In addition, the daily Warfarin maintenance dose for patients was examined for associations with the VKORC1 genotypes at the rs9923231 and rs7294positions. There was no significant difference in allele frequencies between the controls and patients for either SNP. The vii genotypes frequencies for rs9923231 were 25%, 48.4%, 26% for GG, GA, AA genotypes, respectively. In addition, genotypes frequencies for rs7294 variant were 44%, 44%, 12% for GG, GA, AA genotypes, respectively. Crucially, both VKORC1 polymorphisms were found to be strongly associated with the Warfarin doses required to achieve the target international normalized ratio INR (p < 0.0001). The results of this study confirm the suitability of VKORC1 genotyping to guide the use of the appropriate Warfarin dosage for Emiratis.

Comments

هذه الدراسة تعنى بالصيدلة الجينية وذلك بدراسة تاثير المتغيرات الجينية في انزيم VKORC1 على جرعة عقار الوارفرين وهو دواء شائع لعلاج التخثرات الدموية وتسعى هذه الرسالة لمعرفة تردد أهم المتغيرات الجينية في هذا الانزيم في مواطني دولة الامارات ودراسة حقيقة تأثير هذه الانماط الجينية في كل من موقع rs9923231 و rs7294 وطريقة عمل البحث تمت بجمع عينات لامارتين اصحاء عدد 111 ومرضى يتم علاجهم بعقار الوارفرين عدد 69 وذلك بعد موافقة الافراد المشاركين بالدراسة وبعد جمع عينات الدم تم استخلاص مادة الدي ان اي وعمل دراسة جينية عن طريق معرفة السلسلة الجينينه في كل من الموقع rs9923231 و rs7294 واخذ معلومات عن جرعة المرضى اليومية من خلال ملفهم الطبي أدت نتائج هذه الرسالة بمعرفة تردد الانماط الجينية في موقع rs9923231 و كان تردد النمط الجيني ل GG هو 3.52 % و تردد GA %96 وتردد AA هو 39 % ولم يلاحظ اي فرق بين تردد الانماط الجينية بين المرضى والاشخاص الاحصاء وفي موقع rs7294 كان تردد النمط الجيني GG هو 99 % وهو نفس تردد النمط الجيني GA وأما النمط الجيني AA كان الاقل بتردد 13 % و للموقعين الجيني اثر كبير في تحديد الجرعة حسب التحليل الاحصائي للدراسة الا ان الموقع rs9923231 كان له اثر اقوى بالتنبؤ بالجرعة مقارنة بالموقع الجيني rs7294 وتعد هذه اول دراسة لتحديد تردد الانماط الجينيةلانزيم VKORC1 في دولة الامارات العربية ودراسة اهمية هذا التغير في الانماط الجينية على المرضى الذين يتناولون عقار الوارفرين 5

COinS